Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AP000808.2-201ENST00000542410 569 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
COL9A3Q14050 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
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