Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
ALCAMQ13740 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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