Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 HSPB7-203ENST00000406363 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ORMDL1-204ENST00000409519 1223 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LIMS1-206ENST00000414829 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LIMS3-205ENST00000487150 782 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LRRC75A-AS1-209ENST00000481027 1016 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 LRRC75A-AS1-226ENST00000582911 879 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 TCERG1L-AS1-201ENST00000436942 472 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CACNA1SQ13698 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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