Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 HIF3A-218ENST00000600383 2101 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 IRF4-201ENST00000380956 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CUL1Q13616 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ADAM15-206ENST00000368412 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CUL1Q13616 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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