Protein–RNA interactions for Protein: Q13425

SNTB2, Beta-2-syntrophin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNTB2Q13425 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SNTB2Q13425 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms