Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ITGB3BPQ13352 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ITGB3BPQ13352 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ITGB3BPQ13352 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ITGB3BPQ13352 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ITGB3BPQ13352 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
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ITGB3BPQ13352 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ITGB3BPQ13352 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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ITGB3BPQ13352 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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ITGB3BPQ13352 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
ITGB3BPQ13352 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
ITGB3BPQ13352 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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