Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
STRN3Q13033 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
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