Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP3Q12983 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms