Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

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Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
BPTFQ12830 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.04■□□□□ -0
BPTFQ12830 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
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BPTFQ12830 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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BPTFQ12830 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.03■□□□□ -0
BPTFQ12830 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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