Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 CYP4F36P-201ENST00000589193 186 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PROX1-AS1-235ENST00000628896 711 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LRRC75A-AS1-213ENST00000484836 821 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC010504.1-201ENST00000591311 585 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC011287.1-201ENST00000639998 1349 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LIMS1-201ENST00000332345 1235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC112721.1-201ENST00000409162 588 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AL391832.2-203ENST00000423175 554 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 ATP5S-203ENST00000358473 801 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NUP160Q12769 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms