Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DDX3X-201ENST00000399959 5399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NFATC4-219ENST00000555167 4364 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
RIPPLY1Q0D2K3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms