Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
RBBP4Q09028 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ETNPPL-201ENST00000296486 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 NPFFR1-201ENST00000277942 8921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 GNAO1-202ENST00000262494 5767 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
RBBP4Q09028 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms