Protein–RNA interactions for Protein: Q07627

KRTAP1-1, Keratin-associated protein 1-1, humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP1-1Q07627 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PTGR1-209ENST00000538962 1200 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AQP7P5-201ENST00000428759 1049 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AQP7P4-201ENST00000447083 1042 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AQP7P2-201ENST00000453967 1041 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
KRTAP1-1Q07627 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms