Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
PDE4BQ07343 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PDE4BQ07343 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms