Protein–RNA interactions for Protein: Q07002

CDK18, Cyclin-dependent kinase 18, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK18Q07002 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CDK18Q07002 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms