Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL606748.1-201ENST00000423919 655 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL138731.1-201ENST00000452624 739 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ORAOV1-209ENST00000538554 1000 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ATP7AQ04656 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms