Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
NUCB1Q02818 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NUCB1Q02818 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms