Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PLOD1Q02809 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PLOD1Q02809 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms