Protein–RNA interactions for Protein: Q00536

CDK16, Cyclin-dependent kinase 16, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK16Q00536 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CDK16Q00536 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms