Protein–RNA interactions for Protein: Q00403

GTF2B, Transcription initiation factor IIB, humanhuman

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2BQ00403 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
GTF2BQ00403 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
GTF2BQ00403 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms