Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC103808.5-201ENST00000577797 462 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC130709.1-201ENST00000484779 1212 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AP000842.2-201ENST00000533033 517 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 PARD6G-AS1-205ENST00000589574 647 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ERVK-21P61565 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms