Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CHMP2B-201ENST00000263780 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SLC3A1-202ENST00000409229 2909 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PPIP5K1-203ENST00000360135 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PPIP5K1-204ENST00000360301 5565 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PPIP5K1-206ENST00000381885 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ESRRB-201ENST00000380887 2745 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CCDC144B-208ENST00000618081 8688 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MISP-201ENST00000215582 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PLIN3-201ENST00000221957 2333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 GRHL3-203ENST00000356046 2804 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 LAMTOR5-AS1-209ENST00000597455 805 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 GOLGA4-201ENST00000356847 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FBXO44-202ENST00000251547 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PRKCQ-203ENST00000539722 3224 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PMEPA1-205ENST00000395816 4519 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CHST15-202ENST00000435907 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 KLHL3-207ENST00000506491 6566 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ABI1-203ENST00000376137 3467 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SMCR5-201ENST00000543475 2844 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC005921.3-201ENST00000623774 2151 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SPATA13-202ENST00000382095 6665 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AL391294.1-201ENST00000641352 4068 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ARPC5-202ENST00000359856 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 DZIP1-202ENST00000361156 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ARL4C-201ENST00000339728 3385 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TNFRSF8-201ENST00000263932 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ANO3-201ENST00000256737 6642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MYO18A-209ENST00000531253 7504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MYO18A-223ENST00000628822 7501 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 PCDHGB4-202ENST00000615384 4725 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TMEM33-203ENST00000504986 7482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MINK1-203ENST00000453408 3939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 RAPGEF3-202ENST00000395358 4092 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 AC006037.2-201ENST00000622975 2232 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ARAP1-209ENST00000455638 2683 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 SLC18A1-204ENST00000437980 2822 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TMEM178B-202ENST00000565468 10558 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 TMEM178B-203ENST00000610315 10552 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 IQSEC1-204ENST00000613206 3582 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ACAN-201ENST00000352105 7526 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 OSBPL2-203ENST00000439951 3886 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 ENOSF1-203ENST00000383578 4188 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 RANGAP1-201ENST00000356244 3060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
TMEM258P61165 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms