Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CLDN15P56746 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CLDN15P56746 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms