Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SEC13P55735 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.4 ms