Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 KCND3-201ENST00000302127 2659 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ATP6V0A2-207ENST00000544833 1013 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HADHBP55084 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HADHBP55084 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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