Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 F2-201ENST00000311907 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ATP6V0A1-203ENST00000393829 3028 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FNTAP49354 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
FNTAP49354 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FNTAP49354 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.6 ms