Protein–RNA interactions for Protein: P46063

RECQL, ATP-dependent DNA helicase Q1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RECQLP46063 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RECQLP46063 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RECQLP46063 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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