Protein–RNA interactions for Protein: P42898

MTHFR, Methylenetetrahydrofolate reductase, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTHFRP42898 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MTHFRP42898 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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