Protein–RNA interactions for Protein: P40925

MDH1, Malate dehydrogenase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDH1P40925 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CABLES2-201ENST00000279101 3785 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
MDH1P40925 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LDHA-203ENST00000379412 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TRMT2B-203ENST00000372939 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 LINC02048-201ENST00000440556 1771 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TNFAIP8L1-201ENST00000327473 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 PNPLA5-205ENST00000597664 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MDH1P40925 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms