Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
ATP5DP30049 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
ATP5DP30049 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms