Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DPP8-202ENST00000321147 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TAB2-208ENST00000636456 3092 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
HLA-DMAP28067 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms