Protein–RNA interactions for Protein: P25787

PSMA2, Proteasome subunit alpha type-2, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA2P25787 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
PSMA2P25787 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms