Protein–RNA interactions for Protein: P22748

CA4, Carbonic anhydrase 4, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA4P22748 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CA4P22748 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CA4P22748 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CA4P22748 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CA4P22748 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CA4P22748 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CA4P22748 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CA4P22748 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CA4P22748 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms