Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 UGP2-207ENST00000467648 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 C12orf43-202ENST00000445832 2397 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CCDC57-202ENST00000389641 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CCDC57-206ENST00000392347 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 NAALADL1-202ENST00000355721 2100 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SLC25A26-202ENST00000354883 2673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 SPATA20-227ENST00000634597 2587 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 RAB40A-202ENST00000372633 3126 ntAPPRIS P1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CXCL3P19876 LINC00324-201ENST00000315707 2082 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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