Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HDCP19113 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HDCP19113 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HDCP19113 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms