Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 COL20A1-203ENST00000422202 8097 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 ACAP2-201ENST00000326793 7160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DESP17661 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 TSPOAP1-201ENST00000268893 7483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
DESP17661 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
DESP17661 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms