Protein–RNA interactions for Protein: P17600

SYN1, Synapsin-1, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYN1P17600 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYN1P17600 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYN1P17600 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYN1P17600 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYN1P17600 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYN1P17600 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SYN1P17600 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 NME1-NME2-203ENST00000555572 1193 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SYN1P17600 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SYN1P17600 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYN1P17600 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYN1P17600 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYN1P17600 ATP6AP2-213ENST00000636251 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYN1P17600 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SYN1P17600 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms