Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 C14orf178-204ENST00000557011 474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CEP164P1-201ENST00000455142 418 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
EPCAMP16422 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms