Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
CTLA4P16410 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
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