Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
VAV1P15498 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 LYSMD2-204ENST00000560491 1026 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
VAV1P15498 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms