Protein–RNA interactions for Protein: P15056

BRAF, Serine/threonine-protein kinase B-raf, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRAFP15056 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRAFP15056 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRAFP15056 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRAFP15056 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRAFP15056 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
BRAFP15056 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
BRAFP15056 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
BRAFP15056 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 CASP2-207ENST00000619992 4006 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
BRAFP15056 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms