Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CSNK1G2P1-201ENST00000442675 955 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CFTRP13569 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC097059.1-201ENST00000413103 885 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CFTRP13569 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.64
CFTRP13569 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CFTRP13569 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 OR4S1-201ENST00000319988 930 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC093673.1-201ENST00000429630 648 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ING4-207ENST00000446105 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ACYP2-204ENST00000422521 1115 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 ZNF268-210ENST00000541211 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CFTRP13569 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms