Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
ESRRAP11474 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 MTHFR-210ENST00000641407 2387 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
ESRRAP11474 CBFA2T3-201ENST00000268679 4477 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms