Protein–RNA interactions for Protein: P08575

PTPRC, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase C, humanhuman

Predictions only

Length 1,304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCP08575 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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PTPRCP08575 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
PTPRCP08575 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
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