Protein–RNA interactions for Protein: O14828

SCAMP3, Secretory carrier-associated membrane protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP3O14828 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ACR-203ENST00000529621 708 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SCAMP3O14828 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.8 ms