Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNAP23O00161 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms