Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GOLGA8SH3BPF8 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GOLGA8SH3BPF8 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms