Protein–RNA interactions for Protein: C9JE40

PATL2, Protein PAT1 homolog 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATL2C9JE40 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PATL2C9JE40 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms