Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 LINC02536-201ENST00000625799 625 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOBPA7XYQ1 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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