Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TP53I11-222ENST00000616990 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 C15orf41-208ENST00000566621 2866 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 ADCY8-202ENST00000377928 3363 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CFAP73A6NFT4 IL13RA1-202ENST00000371666 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CFAP73A6NFT4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms